A los 20 años de edad, Yusef es el sostén de su casa. Es el tiempo de contraer matrimonio pero el se siente llamado a otra vida.  Después de tres años de espera, escuchó la voz del Señor: "Deja todo, ven y sígueme".  Así, una mañana del año 1851 se dirige al convento de Ntra. Señora de Mayfouq, donde fue recibido como postulante. Al entrar en el noviciado renuncia a su nombre bautismal y escoge como nombre de consagración : Chárbel. 

Un tiempo mas tarde lo envían al Convento de Annaya, en donde profesó los votos perpetuos como monje en 1853.  Lo enviaron inmediatamente al Monasterio de San Cypriano de Kfifen, donde realizó sus estudios de filosofía y teología, llevando una vida ejemplar de obediencia y observancia.  Fue ordenado sacerdote el 23 de julio, de 1859

Disfrutaba pasar su tiempo cantando el oficio en el coro, trabajando en los campos y gozaba de la lectura espiritual, así que nadie se sorprendió cuando eventualmente él pidió, y recibió el permiso para ir a vivir la vida de un ermitaño.

Así comenzó para el Nuevo ermitaño esa vida sagrada que ha sido inalterada desde los días de los Padres en el desierto: su comida consistía en una comida de vegetales al día; no probaba la carne; no tomaba vino salvo una gota en la Eucaristía, y ayunaba durante cuatro periodos anualmente; se negaba a tocar dinero, hacía trabajos manuales santificados por la oración, dormía en un lecho compuesto de hojas y cubiertos con goatskin como cama y un pedazo de madero colocado en el lugar habitual de una almohada, con la interdicción de dejar la ermita sin permiso expreso. San Charbel se puso bajo la obediencia de otro ermitaño, y pasó veintitrés años así, sus diversas austeridades parecían sólo incrementar la robustez de su salud. La única perturbación a su oración venía en la forma de la siempre creciente ola de visitantes atraídos por su reputación de santidad que buscaban consejo, la promesa de oración o algún milagro.

Entonces una mañana, a mediados de Diciembre de 1898, se enfermó sin previo aviso, justo antes de la consagración mientras celebraba una Misa. Sus compañeros le ayudaron a llegar su celda, la cual nunca volvió a dejar. La parálisis gradualmente se apoderó de él. La noche de Navidad murió, repitiendo la oración que no había podido terminar en el altar: "Padre de Verdad, tu hijo amado, que hace un increíble sacrificio por nosotros. Acepta esta ofrenda: Él murió para que yo pudiera vivir. Toma esta ofrenda! Acéptala....."

El padre Chárbel alcanzó la celebridad después de su muerte: su tumba fue inmediatamente rodeada de una "brillantez extraordinaria", según un libro producido por el monasterio sobre su hijo más famoso. Al final esa luz sólo se desvaneció al cabo de 45 días, aunque el interés del público continuó luciendo sin cesar: los peregrinos incluso intentaban robar partes de sus restos mortales, razón por la cual las autoridades abrieron la tumba. Se encontró que el cuerpo flotaba en barro pero sin signos de deterioro, "como si hubiera sido enterrado ese mismo día". Se dieron cuenta de que un "líquido parecido a la sangre" exudaba de su cuerpo - un fenómeno que todavía ahora puede apreciarse. El líquido queda recogido en un trozo de tela y, según el monasterio, ha sido el responsable de curaciones durante todos estos años. En este siglo su tumba se ha abierto cuatro veces, la última fue en 1955, y cada vez "se notaba que su cuerpo sangrante todavía conservaba su flexibilidad como si estuviera vivo".  

En 1950, al pasarle un lienzo por la cara, quedó impreso en la prenda el rostro de Cristo como en el Sudario de Turín. Estos acontecimientos hicieron que el pueblo lo venerara como santo.

Fue beatificado el 5 de diciembre de 1965 por el papa Pablo VI y el 9 de octubre de 1977 fue canonizado siendo el primer santo oriental desde el siglo XIII.

Numerosas de sus imágenes milagrosamente exudan aceite el cual se utiliza en la oración por los enfermos.